Skip to Content.

mget-help - [mget-help] MGET tool failing to execute

Please Wait...

Subject: Marine Geospatial Ecology Tools (MGET) help

Text archives


From: Bryan Dieter - NOAA Affiliate <>
To:
Subject: [mget-help] MGET tool failing to execute
Date: Thu, 29 Aug 2013 11:29:28 -1000
Hello,

I have been trying to create a climatological raster using the MGET tool 'Create Climatological Rasters for HYCOM GLBa0.08 Equatorial 4D Variable'.  Attached is the text from the tool's dialog after failing.  It looks like the server is not responding, but I can't say for sure.  Any advice would be much appreciated.  Let me know if you have questions.

Thanks,

Bryan Dieter, GIS Technician II

Contractor with Ocean Associates, Inc
Pacific Islands Fisheries Science Center
808-983-2965

Executing: HYCOMGLBa008Equatorial4DCreateClimatologicalArcGISRasters salinity 
Mean Cumulative C:\_bryan\MGET_extract\salinity Add 
%(VariableName)s;%(ClimatologyBinType)s_Climatology;Depth_%(Depth)04.0fm;%(VariableName)s_%(Depth)04.0fm_%(ClimatologyBinName)s_%(Statistic)s.img
 1 1 # true # Degrees # # # # 120 240 # true false
Start Time: Thu Aug 29 08:24:20 2013
Running script HYCOMGLBa008Equatorial4DCreateClimatologicalArcGISRasters...
Importing 33 datasets into ArcGIS Folder C:\_bryan\MGET_extract\salinity with 
mode "add".
Checking for existing destination datasets.
Finished checking: 0:00:00 elapsed, 33 datasets checked, 0:00:00.000787 per 
dataset.
0 destination datasets already exist. Importing 33 datasets.
Failed to retrieve data slice salinity[156:157,0:1,2172:2485,698:2074] of 
OPeNDAP URL http://tds.hycom.org/thredds/dodsC/glb_analysis due to timeout: ;
timed out. Retrying...
Import stopped before all datasets were imported: 2:30:47 elapsed, 0 datasets 
imported, 0:00:00 per dataset, 33 datasets not imported.
RuntimeError: Failed to retrieve the data slice 
[156:157,0:1,2172:2485,698:2074] of Grid variable salinity of OPeNDAP URL 
http://tds.hycom.org/thredds/dodsC/glb_analysis due to timeout: timed out. ;
The request was retried for 240 seconds without success. Check that the 
OPeNDAP server is operating properly and that your computer can connect to 
it. If necessary, contact the server's operator for assistance. If the server 
and network are operating properly, this problem could be a programming error 
in this tool. If you suspect one, contact the author of this tool for 
assistance. Error details: timeout: timed out

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Program 
Files\GeoEco\ArcGISToolbox\Scripts\HYCOMGLBa008Equatorial4DCreateClimatologicalArcGISRasters.py",
 line 5, in <module>
    ExecuteMethodFromCommandLineAsArcGISTool('GeoEco.DataProducts.HYCOM', 
'HYCOMGLBa008Equatorial4D', 'CreateClimatologicalArcGISRasters')
  File "C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\ArcGISScripts.py", 
line 210, in ExecuteMethodFromCommandLineAsArcGISTool
    exec sourceCode in globals(), locals()
  File "<string>", line 1, in <module>
  File 
"C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\DataProducts\HYCOM.py", line 
1743, in CreateClimatologicalArcGISRasters
    workspace.ImportDatasets(grids, mode, 
calculateStatistics=calculateStatistics, buildPyramids=buildPyramids)
  File 
"C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\__init__.py", line 
815, in ImportDatasets
    self._ImportDatasets(datasets, mode.lower(), reportProgress, options)
  File 
"C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\Collections.py", 
line 694, in _ImportDatasets
    self._ImportDatasetsToPath(pathComponentsForPath[path], 
datasetsForPath[path], mode, progressReporter, options)
  File "C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\ArcGIS.py", 
line 607, in _ImportDatasetsToPath
    self.DatasetType._ImportDatasetsToPath(os.path.join(self.Path, 
*pathComponents), sourceDatasets, mode, progressReporter, options)
  File "C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\ArcGIS.py", 
line 1119, in _ImportDatasetsToPath
    GDALDataset._ImportDatasetsToPath(path, sourceDatasets, mode, None, 
{'useArcGISSpatialReference': True, 'useUnscaledData': useUnscaledData, 
'calculateStatistics': False, 'blockSize': blockSize})
  File "C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\GDAL.py", 
line 1073, in _ImportDatasetsToPath
    data = sourceDatasets[i].Data[rowsCopied:rowsCopied+rowsToCopy, :]
  File 
"C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\__init__.py", line 
3626, in __getitem__
    return getattr(self._Grid(), self._GetMethod)(key)
  File "C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\Virtual.py", 
line 562, in _GetUnscaledDataAsArray
    return self._Grid._GetUnscaledDataAsArray(self._AddSlicedDimsToKey(key))
  File 
"C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\__init__.py", line 
3266, in _GetUnscaledDataAsArray
    data, actualNoDataValue = self._ReadNumpyArray(reorderedSliceList)
  File "C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\Virtual.py", 
line 2074, in _ReadNumpyArray
    data = self._Grids[i].Data.__getitem__(tuple(sliceList))
  File 
"C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\__init__.py", line 
3626, in __getitem__
    return getattr(self._Grid(), self._GetMethod)(key)
  File "C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\Virtual.py", 
line 562, in _GetUnscaledDataAsArray
    return self._Grid._GetUnscaledDataAsArray(self._AddSlicedDimsToKey(key))
  File 
"C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\__init__.py", line 
3266, in _GetUnscaledDataAsArray
    data, actualNoDataValue = self._ReadNumpyArray(reorderedSliceList)
  File 
"C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\DataProducts\HYCOM.py", line 
1581, in _ReadNumpyArray
    return _HYCOMGridGLBa0083D._ReadNumpyArrayForDataset(self, sliceList)     
   # This function handles both 3D and 4D grids.
  File 
"C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\DataProducts\HYCOM.py", line 
1249, in _ReadNumpyArrayForDataset
    cls._InterpolateExtendedRegion(dataset, sliceList, datasetIs4D, result, 
tCoords, gridTCoords, gridTStart, gridTStop, extendedYSlice, ySliceToWrite, 
698, 2074, '_PacificLookupGrids', 'HYCOM_Glb008_y1.bin', 
'HYCOM_Glb008_x1.bin', (276, 1376))
  File 
"C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\DataProducts\HYCOM.py", line 
1297, in _InterpolateExtendedRegion
    data = dataset._OpenGrid.UnscaledData.__getitem__((slice(gridTStart, 
gridTStop), sliceList[1], slice(int(bipolarYStart + (2172-390)), 
int(bipolarYStop + (2172-390))), slice(int(bipolarXStart + xStart), 
int(bipolarXStop + xStart))))
  File 
"C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\__init__.py", line 
3626, in __getitem__
    return getattr(self._Grid(), self._GetMethod)(key)
  File 
"C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\__init__.py", line 
3266, in _GetUnscaledDataAsArray
    data, actualNoDataValue = self._ReadNumpyArray(reorderedSliceList)
  File "C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\Virtual.py", 
line 1058, in _ReadNumpyArray
    return self._Grid._ReadNumpyArray(slicesToRead)
  File "C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\OPeNDAP.py", 
line 927, in _ReadNumpyArray
    downloadedData = self._GetSliceFromServer(sliceList).reshape(map(lambda 
s: s.stop-s.start, sliceList))
  File "C:\Python27\ArcGIS10.1\lib\site-packages\GeoEco\Datasets\OPeNDAP.py", 
line 1101, in _GetSliceFromServer
    raise RuntimeError(_(u'Failed to retrieve the data slice [%(slice)s] of 
%(dn)s due to %(e)s: %(msg)s. The request was retried for %(retry)i seconds 
without success. Check that the OPeNDAP server is operating properly and that 
your computer can connect to it. If necessary, contact the server\'s operator 
for assistance. If the server and network are operating properly, this 
problem could be a programming error in this tool. If you suspect one, 
contact the author of this tool for assistance. Error details: %(e)s: 
%(msg)s') % {u'slice': sliceName, u'dn': self.DisplayName, u'retry': 
self.ParentCollection._MaxRetryTime, u'e': e.__class__.__name__, u'msg': 
self._Unicode(e)})
RuntimeError: Failed to retrieve the data slice 
[156:157,0:1,2172:2485,698:2074] of Grid variable salinity of OPeNDAP URL 
http://tds.hycom.org/thredds/dodsC/glb_analysis due to timeout: timed out. ;
The request was retried for 240 seconds without success. Check that the 
OPeNDAP server is operating properly and that your computer can connect to 
it. If necessary, contact the server's operator for assistance. If the server 
and network are operating properly, this problem could be a programming error 
in this tool. If you suspect one, contact the author of this tool for 
assistance. Error details: timeout: timed out

Failed to execute (HYCOMGLBa008Equatorial4DCreateClimatologicalArcGISRasters).
Failed at Thu Aug 29 10:55:14 2013 (Elapsed Time: 2 hours 30 minutes 54 
seconds)
Archives powered by MHonArc.
Top of Page